Die ersten Bewohner in das 'Cueva de las Arañas' wohnten in dem dritten, vierten Jahrtausend v.Ch.. Dann findet man eine mit einem Mauer umgebene iberische Ansiedlung des IV. Jahrhunderts v. Ch.. Ab dem I. Jahrhundert nach Ch. mit dem Ankommen der Römer wurde sich die Gegend 'Portus Illicitanus' genannt und es war ein der Haupthafen des maritimen Handels. Von dieser Epoche werden viele archäologische Spüre gehalten. Ab dem XVIII. Jahrhundert wird sich die Bevölkerung auf die Burg, Kern, von dem die Entwicklung des Dorfes abreist, gruppiert. Heutzutage ist Santa Pola eine touristische Gemeinde, die mit der wichtigsten Fischerflotte des spanischen Mittelmeers zählt.